Appenzellerland-alueelta saatavat puhtaat ainesosat, erityisesti sen paikallinen maito, ja perinteikäs valmistustaito, salainen yrttiliemi sekä vaativa laadunhallintaprosessi ovat Sveitsin maukkaimman juuston tärkeimmät komponentit.
Appenzeller®-juuston ainutkertaisen maun salaisuus on huolella varjeltu yrttiliemi, jonka valmistukseen on käytetty erilaisia yrttejä, juuria, kasvien osia ja siemeniä. Liemen ainesosat sujautetaan suuriin ”teepusseihin”, joiden annetaan hautua vahvassa alkoholissa noin 6–8 viikkoa. Tämän kylmäuuttamisprosessin aikana alkoholi imee itseensä salaisen sekoituksen aromeja ja makuja ja tekeytyy yrttiliemeksi, jota laimennetaan vedellä ja suolalla. Lopulta yrttilientä sivellään säännöllisesti juuston kuoren pintaan kypsytysprosessin aikana. Näin se imeytyy hiljalleen kaikkialle juustoon antaen Appenzeller®-juustolle sen ominaisen kirpeän maun. Juuston jatkaessa kypsymistään yrttiliemen tuomat aromit ja maut voimistuvat entisestään, ja juuston mausta tulee yhä vahvempi ja rikkaampi. Vain kaksi henkilöä koko maailmassa tuntevat salaisen yrttiliemen tarkat ainesosat ja reseptin, joka luovutetaan sukupolvelta toiselle. Yrttiliemen salaisuutta varjellaan edelleen yhtä huolella kuin vuosisatoja sitten.